Buddy Daddies è la storia di Kazuki Kurusu, un intermediario criminale, e Rei Suwa, sicario professionista che vive insieme a lui. Kazuki è estroverso ed ama il gioco d'azzardo e le donne, mentre Rei è di poche parole e spende la maggior parte del suo tempo giocando ai videogiochi. Un giorno i due compagni, durante un incarico, finiscono per prendersi cura di Miri Unasaka, una bambina di quattro anni figlia di un boss mafioso, che cambierà radicalmente la loro vita.